Una serie di misteriosi omicidi porta Lara a confrontarsi con un sinistro Alchimista che viene dal passato ed una alleanza segreta di individui potenti legati da un mistero. Al centro di tutti questi misteri vi sono i Dipinti di Obscura - 5 capolavori del 14esimo secolo che l'Alchimista sta cercando di riavere. Inseguita dalla polizia, segue l'Alchimista in un oscuro mondo di sangue, tradimenti e vendetta dove solo lei avrà la possibilità di sconfiggere l'alleanza malefica.